中國醫藥大學為全國發展中醫藥最具歷史與特色的醫學大學，60年來為國家培育萬餘名中醫與藥學專業人才，建構了世界最大的中醫藥資料庫、擁有最堅强的中藥研發專家與全國最完整的中醫臨床醫師陣容，中醫藥領域研究成果在論文之品質、數量與被引用次數皆位居全國首位、世界前茅。

       中國醫藥大學研究團隊在中醫針灸與中藥研發上已具有相當成就，在既有的教育部支持的頂尖「中醫藥研究中心」架構下，利用中國醫藥大學的中醫針灸與中藥研究基礎加上臨床治療經驗的優勢，結合全校頂尖團隊卓越的研究能力，利用多學科基礎與臨床的分工合作，共同開發對難以治癒的疾病之新穎或輔助醫療對策。

       中心研究主軸包括：一、針灸治療神經系統疾病的基礎機轉，特別是研究穴位微環境與經絡循行的待解決難題，並進行針灸與中藥複方的臨床試驗，推動中醫藥實證醫學。二、中藥研究從古方中找尋用於治療代謝、免疫、癌症等疾病的單味藥與中藥複方，並純化、鑑定、測試活性、了解分子機轉，進行臨床前試驗與臨床試驗。三、中藥的品質管控，這是中醫藥研究與產業最重要的關鍵問題，本中心藉由中醫大既有的研究平台，特別著重在將功能性路徑分析、基因圖譜與功能性代謝體學應用在中藥的質量控制，提升中藥研發之能量。

       本中心將針對以上目標擬定五年計畫，透過全國最優秀的中醫藥研究團隊，從基礎、臨床前轉譯、銜接臨床研究，藉此解決醫療的困境與中醫藥產業發展的關鍵技術，提升研究與產業的能量與水準，達到突破性的發展，預期研發產出至少三種以上新療法或中藥進入或完成第三期臨床試驗，以期對全國及全人類做出貢獻，成功完成此五年計畫也將兼具學術與產業價值，使本校成為世界級頂尖中醫藥研發重鎮。